果汁生產線一般在85℃～95℃進行15分鐘到30分鐘的殺菌。對于混濁果汁一般采用高溫短時殺菌，因為混濁果汁加熱時間過長容易產生煮過味，而且色澤和香味損失也比較大。殺菌后迅速降溫再進行后續包裝。
 

　　果汁生產線在預處理過程中要注意的是，對農藥殘留較多的果蔬，清洗時可加用稀鹽酸或脂肪酸進行處理；對于微生物污染，可用一定濃度的高錳酸鉀溶液浸泡，然后清水清洗。在大多數水果破碎之后，榨汁之前都必須進行預熱處理，目的是使果肉組織軟化提高出汁率；另外不同的預熱溫度可以促進或者抑制酶的活性，根據酶的性質不同掌握適當的PH值、溫度和作用時間，直接影響zui終產品的色澤和風味，所以根據不同的市場需求，必須把握好不同的處理工藝。在果汁澄清中有幾種方法可以達到澄清目的，酶法，明膠—單寧法，酶—明膠法，硅藻土法等。值得注意的是，在使用酶法的時候，一般果膠酶的適用PH值為4.5～5.0，溫度為50℃，如果是葡萄汁加工，還要進行專門的除酒石。
 

　　果汁的調整混合，即調配過程。包括糖度的調整，固酸比的確定，維生素C的添加等。使zui終產品達到一定的規格，是對zui終產品的營養、口味、色澤起決定性的一步。在生產混濁果汁的時候還必須對果汁進行均質，防止固液分離、分層，促進口感更細膩。為防止果汁氧化變質，還需對果汁進行脫氣，除去前處理過程中混入的大量氧氣、二氧化碳和氮氣。果汁濃縮一般都采用降膜式濃縮，而且需要在真空狀態下，低溫、快速、高效的濃縮，在確保這些條件達到的情況下，使濃縮鍋實現節能化，以降低生產成本。在濃縮的過程中，通常需要對果汁進行芳香回收，蘋果汁芳香回收率一般在8%～10%，葡萄汁和橙汁在26%～30%。